曽根遺跡からはじまった諏訪の考古学ですが、本格的な発展や調査が進んだのは戦後に入ってからでした。特に調査・研究をリードしていったのが、藤森栄一（1911年～1973年）です。考古学の道に進みたかった藤森ですが、商家の生まれということもあって許されず、当時の中学校を卒業すると家業を継ぎました。それでも藤森の情熱は冷めず、独学で一流の考古学者になりました。 そして戦後、兵役から帰った藤森が立ち上げたのが「諏訪考古学研究所」でした。

諏訪湖を望む高台で行われていた住宅工事の現場で、黒曜石製などの石器がたくさん出てきました。見つけたのは高校生・松沢亜生。諏訪考古学研究所員でした。同じく所員の大学生・戸沢充則と松沢は、石器の形や出土した地層から、遺跡が1万数千年以上前の旧石器時代のものだと推測。この説はその後の調査で裏付けられました。茶臼山遺跡は、関東地方以外で発見された初めての旧石器時代遺跡で、日本に旧石器時代があったことを決定的付けた遺跡なのです。